外三科（胃肠外科）科学规范治疗胃、小肠、结肠、直肠、腹腔、腹膜后、胰腺等部位的肿瘤、炎症、畸形以及其他外科疾病的诊治。

外三科（胃肠外科）在消化道肿瘤的诊治方面有较深入的研究。腹腔镜微创手术已为科室常规手术，熟练开展胃肠道肿瘤的腹腔镜微创手术治疗，腹腔镜直肠癌超低位保肛手术，腹腔镜低位直肠癌经括约肌间切除术（ISR），腹腔镜结直肠癌经自然腔道切除术（NOSES），治疗代谢疾病的减重手术（袖状胃切除、胃转流术）等。腹腔镜辅助的胃癌、结直肠癌手术具有腹部切口小（或无切口）、手术操作精细、肠胃道干扰小、视野放大清楚、淋巴结清扫彻底、出血少、手术中肿瘤受挤压少，对机体免疫功能影响小,手术后肠粘连少及手术后疼痛轻、手术后恢复快,并发症低等优点，具有传统开放手术无法比拟的微创效果；胃癌手术依据术前分期、外科分型、生长方式分型、转移淋巴结及浆膜分型等，以无瘤原则为基础，选择不同手术方式，并在手术治疗之后，依据临床病理分期有选择地采用辅助化疗等综合治疗方法；在大肠癌诊治方面保留植物神经直肠癌切除术、超低位直肠（距齿状线1-2厘米）癌保留肛门，使大部分以上直肠癌病人免于腹壁造口之苦，明显提高了患者的生存质量；率先开展胃癌D2、结、直肠癌全系膜切除、扩大淋巴结清除术(D2、D3)；胰腺癌全胰切除及胰十二指肠切除、腹腔巨大肿瘤切除、脾脏肿瘤以及常见复发癌二次根治术等。